无照经营行为的处罚包括取缔、没收违法所得、罚款等，如果触犯刑律还会追究刑事责任。提供无照经营条件的也将受到处罚。违法所得的认定按全部收入计算，不扣除直接用于经营活动的支出，但需扣除相关税费。供述的非法所得数额不能单独作为定罪量刑的依据，必须有其他证据支持。
法律分析
一、无照经营工商部门如何处罚
根据《无照经营查处取缔办法》第十四条规定：
1、对于无照经营行为，由工商行政管理部门依法予以取缔，没收违法所得;
2、触犯刑律的，依照刑法关于非法经营罪、重大责任事故罪、危险物品肇事罪或者其他罪的规定，依法追究刑事责任;
3、尚不够刑事处罚的，并处2万元以下罚款;
4.无照经营行为危害人体健康、存在重大安全隐患、威胁公共安全、破坏环境资源的，没收专门用于从事无照经营的工具、设备、原材料、产品(商品)等财物，并处5万元以上50万元以下的罚款。
5.对无照经营行为的处罚，法律、法规另有规定的，从其规定。
6.从事无照经营的，由工商行政管理部门依照相关法律、行规的规定予以处罚。法律、行规对无照经营的处罚没有明确规定的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得，并处的罚款。
7.明知属于无照经营而为经营者提供经营场所，或者提供运输、保管、仓储等条件的，由工商行政管理部门责令停止违法行为，没收违法所得。
8.任何单位或者个人从事无证无照经营的，由查处部门记入信用记录，并依照相关法律、法规的规定予以公示。
9.妨害查处部门查处无证无照经营，构成违反治安管理行为的，由机关依照《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定予以处罚。
二、无照经营违法所得认定是如何的
《无照经营查处取缔办法》第十五条规定：“知道或者应当知道属于本办法规定的无照经营行为而为其提供生产经营场所、运输、保管、仓储等条件的，由工商行政管理部门责令立即停止违法行为，没收违法所得，并处2万元以下的罚款;为危害人体健康、存在重大安全隐患、威胁公共安全、破坏环境资源的无照经营行为提供生产经营场所、运输、保管、仓储等条件的，并处5万元以上50万元以下的罚款。”工商行政管理部门在执行该条规定，认定违法所得时，应按照《工商行政管理机关行政处罚案件违法所得认定办法》第六条“违反法律、法规的规定，为违法行为提供便利条件的违法所得按当事人的全部收入计算”的规定，计算全部收入，不扣除当事人直接用于经营活动的支出。但应扣除《工商行政管理机关行政处罚案件违法所得认定办法》第九条所规定的相关税费。
供述的非法所得数额，不得单方面作为定罪量刑的依据。法律规定：只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚;没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
结语
依据《无照经营查处取缔办法》第十四条和第十五条规定，对于无照经营行为，工商行政管理部门将依法予以取缔并没收违法所得。如果无照经营行为触犯刑律，将依据相关刑法规定追究刑事责任。此外，根据违法行为的性质和危害程度，还可能处以罚款、没收财物等处罚措施。工商行政管理部门在认定违法所得时，将按照相关规定计算全部收入，不扣除直接用于经营活动的支出，但应扣除相关税费。需要注意的是，只有被告人供述不能单方面作为定罪量刑的依据，必须有其他充分证据支持。
法律依据
中华人民共和国价格法：第六章 法律责任 第四十三条 经营者被责令暂停相关营业而不停止的，或者转移、隐匿、销毁依法登记保存的财物的，处相关营业所得或者转移、隐匿、销毁的财物价值一倍以上三倍以下的罚款。
中华人民共和国价格法：第五章 价格监督检查 第三十五条 经营者接受价格主管部门的监督检查时，应当如实提供价格监督检查所必需的帐簿、单据、凭证、文件以及其他资料。