清真标志办理流程如下：
1、首先需要确定您要申请清真标识的产品，确保产品符合教法的食品要求；
2、将申请材料准备齐全，包括企业的营业执照、生产工艺流程、生产环节的清真反证书、注册商标证书和生产经营许可证等；
3、选择当地的清真认证机构；
4、向清真认证机构递交申请材料，申请人需要向认证机构提供真实、准确的材料和资料，并承担申请费用；
5、清真认证机构对材料进行审核，如需要现场核查，认证机构会安排专人进行核查；
6、审核通过后，认证机构会为企业颁发清真认证证书及标识。
清真食品商标申请程序如下：
1、先对商标进行查询，如果在先没有相同或近似的，就可以制作申请文件，递交申请了；
2、申请递交后3个月左右，商标局会给你下发一个申请受理通知书（这个期间叫形式审查阶段）；
3、形式审查完毕后，就进入实质审查阶段，这个阶段大概需9个月左右；
4、如果实质审查合格，就进入公告程序（这个期间是3个月，也叫异议期间）；
5、公告期满，无人提异议的。就可以拿注册证了。
综上所述，清真认证的申请和审核过程相对复杂，建议在申请前认真阅读清真认证机构的申请要求，确保申请材料准确齐全，并遵守教法要求。同时，在选择清真认证机构时，最好选择正规机构，以确保认证的权威性和可信性。
【法律依据】：
《中华人民共和国行政许可法》第三十九条
行政机关作出准予行政许可的决定，需要颁发行政许可证件的，应当向申请人颁发加盖本行政机关印章的下列行政许可证件：
（一）许可证、执照或者其他许可证书；
（二）资格证、资质证或者其他合格证书；
（三）行政机关的批准文件或者证明文件；
（四）法律、法规规定的其他行政许可证件。
行政机关实施检验、检测、检疫的，可以在检验、检测、检疫合格的设备、设施、产品、物品上加贴标签或者加盖检验、检测、检疫印章。